15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3007 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  624  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  26.72 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  27.99 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  27.99 
 
 		 398 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  22.34 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  28.7 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  21.78 
 
 		 385 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2279  ATP-binding region, ATPase-like  30.28 
 
 		 280 aa  55.1  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  26.97 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3755  hypothetical protein  28.24 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  20 
 
 		 340 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 162 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  26.99 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  26.99 
 
 		 437 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3299  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 		 757 aa  43.1  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>