14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03060 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_03060  histidine kinase  100 
 
 		 330 aa  683    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00100507  hitchhiker  2.5063000000000002e-30 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  26.72 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0060  ATP-binding region, ATPase-like  24.91 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  23.95 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  23.95 
 
 		 398 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  24.75 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  25.66 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  22.96 
 
 		 385 aa  47.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  25.33 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1788  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.93 
 
 		 361 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0760005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1128  hypothetical protein  42.59 
 
 		 267 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  21.12 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  21.12 
 
 		 437 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3493  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 		 867 aa  42.4  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.789076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>