14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3121 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  100 
 
 		 436 aa  898    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  56.22 
 
 		 437 aa  519  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  51.72 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  51.72 
 
 		 437 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  26.74 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  33.33 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  31.79 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  30.81 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  32.82 
 
 		 398 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3007  hypothetical protein  26.97 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0520371  normal  0.102422 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3006  hypothetical protein  32.18 
 
 		 103 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.165579  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3755  hypothetical protein  23.08 
 
 		 292 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2791  hypothetical protein  21.21 
 
 		 395 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000237815  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1500  ATP-binding region, ATPase-like protein  26.05 
 
 		 291 aa  46.2  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>