17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1500 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1500  ATP-binding region, ATPase-like protein  100 
 
 		 291 aa  598  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0060  ATP-binding region, ATPase-like  35.17 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3239  hypothetical protein  26.9 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  26.28 
 
 		 385 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  26.55 
 
 		 340 aa  48.9  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  24.32 
 
 		 244 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  25.4 
 
 		 437 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  26.05 
 
 		 436 aa  46.2  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  35.29 
 
 		 1574 aa  45.8  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2279  ATP-binding region, ATPase-like  28.03 
 
 		 280 aa  45.8  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 936 aa  45.8  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  26.8 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3755  hypothetical protein  25.47 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 779 aa  44.3  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  25.56 
 
 		 773 aa  43.5  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  30.48 
 
 		 1200 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>