12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3153 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  907    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  53.81 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  53.81 
 
 		 437 aa  514  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  56.22 
 
 		 436 aa  511  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  24.44 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3006  hypothetical protein  40.32 
 
 		 103 aa  47.4  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.165579  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1500  ATP-binding region, ATPase-like protein  25.4 
 
 		 291 aa  46.6  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  26.79 
 
 		 344 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  26.79 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  26.79 
 
 		 269 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  25.63 
 
 		 342 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  31.13 
 
 		 328 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>