17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1511 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  100 
 
 
328 aa  680    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  33.22 
 
 
342 aa  126  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1705  hypothetical protein  28.83 
 
 
385 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00646278  normal  0.0869394 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0554  hypothetical protein  28 
 
 
340 aa  102  7e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0136677  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  29.73 
 
 
437 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  29.73 
 
 
437 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2791  hypothetical protein  27.57 
 
 
395 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000237815  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.8 
 
 
162 aa  56.2  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  26.85 
 
 
344 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  26.85 
 
 
398 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  24.84 
 
 
244 aa  48.1  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  31.36 
 
 
465 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3044  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  27.78 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000216178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3755  hypothetical protein  34.18 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  26.67 
 
 
269 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3153  hypothetical protein  31.13 
 
 
437 aa  43.5  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.11854 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2942  peptidase M24  27.35 
 
 
386 aa  42.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000180841  hitchhiker  0.000133578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>