13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2791 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2791  hypothetical protein  100 
 
 		 395 aa  820    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000237815  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1511  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.57 
 
 		 328 aa  60.8  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 		 162 aa  59.3  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2639  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  54.3  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  20 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  20 
 
 		 437 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  29.03 
 
 		 342 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3356  ATPase-like protein  34.78 
 
 		 367 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2718  hypothetical protein  30.38 
 
 		 99 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3121  hypothetical protein  21.21 
 
 		 436 aa  46.6  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.673952 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1128  hypothetical protein  34.94 
 
 		 267 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.313033  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2678  hypothetical protein  30.38 
 
 		 101 aa  45.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1139  hypothetical protein  23.16 
 
 		 244 aa  44.7  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>