23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2639 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2639  hypothetical protein  100 
 
 		 303 aa  607  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000551636  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0033  hypothetical protein  27.81 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.758956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0033  hypothetical protein  27.81 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000163665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3755  hypothetical protein  28.92 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1761  hypothetical protein  26.26 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2373  hypothetical protein  26.26 
 
 		 437 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2791  hypothetical protein  31.25 
 
 		 395 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000237815  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1402  ATP-binding region ATPase domain protein  25.43 
 
 		 362 aa  51.6  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3356  ATPase-like protein  23.05 
 
 		 367 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  27.94 
 
 		 2476 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  27.94 
 
 		 2458 aa  47  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2540  ATP-binding region, ATPase-like  23.4 
 
 		 342 aa  45.8  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00366162  hitchhiker  0.0000000000468355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 		 691 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0031  hypothetical protein  27.52 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.770133 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 		 1974 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0880  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.7 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 1646 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  28.47 
 
 		 1992 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 1647 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 1646 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0060  ATP-binding region, ATPase-like  23.6 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  26.28 
 
 		 2284 aa  43.1  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 2423 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>