19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3720 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  904    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  50.44 
 
 		 455 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  44.74 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  41.21 
 
 		 457 aa  382  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  41 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0537  hypothetical protein  41 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4018  hypothetical protein  41.21 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3258  hypothetical protein  41.74 
 
 		 456 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.859487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3741  hypothetical protein  42.17 
 
 		 456 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0623  hypothetical protein  42.17 
 
 		 456 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0650  hypothetical protein  41.74 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0646  hypothetical protein  41.52 
 
 		 456 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2602  hypothetical protein  35.82 
 
 		 460 aa  290  4e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0209779  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03457  hypothetical protein  28.61 
 
 		 464 aa  169  7e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000189701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  27.33 
 
 		 456 aa  161  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0144  putative lipoprotein  23.61 
 
 		 506 aa  104  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1430  putative lipoprotein  24.19 
 
 		 503 aa  74.3  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000120466  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01014  hypothetical protein  22.44 
 
 		 819 aa  44.3  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  22.33 
 
 		 452 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>