17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2602 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2602  hypothetical protein  100 
 
 		 460 aa  936    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0209779  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  35.82 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  36.03 
 
 		 457 aa  279  6e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  35.59 
 
 		 457 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0537  hypothetical protein  35.59 
 
 		 457 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4018  hypothetical protein  33.55 
 
 		 456 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  32.7 
 
 		 455 aa  265  1e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3258  hypothetical protein  35.01 
 
 		 456 aa  253  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.859487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0623  hypothetical protein  33.92 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0646  hypothetical protein  33.19 
 
 		 456 aa  248  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3741  hypothetical protein  33.7 
 
 		 456 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  31.29 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0650  hypothetical protein  33.48 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03457  hypothetical protein  26.95 
 
 		 464 aa  171  3e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000189701  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  27.21 
 
 		 456 aa  167  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0144  putative lipoprotein  22.44 
 
 		 506 aa  106  8e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1430  putative lipoprotein  20.73 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000120466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>