17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0623 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3741  hypothetical protein  99.56 
 
 
456 aa  924    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0646  hypothetical protein  98.68 
 
 
456 aa  917    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0650  hypothetical protein  98.9 
 
 
456 aa  920    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0623  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  926    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3258  hypothetical protein  91.01 
 
 
456 aa  854    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.859487  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  79.21 
 
 
457 aa  750    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0537  hypothetical protein  78.34 
 
 
457 aa  746    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  78.56 
 
 
457 aa  746    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4018  hypothetical protein  76.54 
 
 
456 aa  729    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  42.17 
 
 
455 aa  374  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  34.72 
 
 
455 aa  273  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  30.48 
 
 
456 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2602  hypothetical protein  33.63 
 
 
460 aa  238  2e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0209779  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  25.27 
 
 
456 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03457  hypothetical protein  26.87 
 
 
464 aa  125  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000189701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0144  putative lipoprotein  22.6 
 
 
506 aa  95.1  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1430  putative lipoprotein  21.22 
 
 
503 aa  63.2  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000120466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>