20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0708 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  100 
 
 		 455 aa  923    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  50.44 
 
 		 455 aa  450  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  45.66 
 
 		 456 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  36.75 
 
 		 457 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4018  hypothetical protein  35.94 
 
 		 456 aa  300  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  36.89 
 
 		 457 aa  299  7e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0537  hypothetical protein  36.08 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3258  hypothetical protein  35.59 
 
 		 456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.859487  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0623  hypothetical protein  35.15 
 
 		 456 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3741  hypothetical protein  34.93 
 
 		 456 aa  280  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0650  hypothetical protein  34.72 
 
 		 456 aa  277  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0646  hypothetical protein  34.72 
 
 		 456 aa  276  4e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2602  hypothetical protein  31.92 
 
 		 460 aa  265  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0209779  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  30.07 
 
 		 456 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03457  hypothetical protein  29.35 
 
 		 464 aa  183  7e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000189701  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0144  putative lipoprotein  23.49 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1430  putative lipoprotein  26.65 
 
 		 503 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000120466  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  22.71 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002699  hypothetical protein  24.76 
 
 		 442 aa  47.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174036  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03285  hypothetical protein  24.54 
 
 		 452 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>