18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1430 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1430  putative lipoprotein  100 
 
 		 503 aa  981    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000120466  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0144  putative lipoprotein  41.39 
 
 		 506 aa  333  3e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03457  hypothetical protein  26.72 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000189701  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3720  hypothetical protein  24.54 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000107792  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3258  hypothetical protein  22.61 
 
 		 456 aa  99  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.859487  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0708  hypothetical protein  25.41 
 
 		 455 aa  97.4  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000336501  decreased coverage  0.0000114896 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3568  hypothetical protein  23.6 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000948267  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3741  hypothetical protein  21.84 
 
 		 456 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0623  hypothetical protein  21.84 
 
 		 456 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0650  hypothetical protein  21.84 
 
 		 456 aa  87.8  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0646  hypothetical protein  21.43 
 
 		 456 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3415  hypothetical protein  22.38 
 
 		 457 aa  87  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.636274 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1854  hypothetical protein  22.62 
 
 		 456 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000041317  unclonable  0.00000314319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0537  hypothetical protein  21.98 
 
 		 457 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3585  hypothetical protein  22.18 
 
 		 457 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4018  hypothetical protein  21.14 
 
 		 456 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2602  hypothetical protein  21.92 
 
 		 460 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0209779  normal  0.673279 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4613  hypothetical protein  21.83 
 
 		 452 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>