181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0078 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0078  MOSC domain-containing protein  100 
 
 		 230 aa  484  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0281  MOSC domain-containing protein  70.04 
 
 		 231 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0385  MOSC domain-containing protein  69.6 
 
 		 231 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0273  MOSC domain-containing protein  70.04 
 
 		 231 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0277  MOSC domain containing protein  70.04 
 
 		 237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0269  MOSC domain-containing protein  69.6 
 
 		 231 aa  334  7e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.480151  hitchhiker  0.0000407513 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0270  MOSC domain-containing protein  69.6 
 
 		 231 aa  334  7e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.112146  hitchhiker  0.00000109327 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0280  MOSC domain-containing protein  69.91 
 
 		 229 aa  334  7e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.077384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3752  MOSC domain-containing protein  69.16 
 
 		 231 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4456  hypothetical protein  68.28 
 
 		 231 aa  332  4e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4123  MOSC domain-containing protein  68.89 
 
 		 232 aa  330  1e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4406  MOSC domain-containing protein  65.93 
 
 		 232 aa  321  5e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0712401 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4797  MOSC domain-containing protein  66.82 
 
 		 232 aa  318  3e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107513 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0083  MOSC domain-containing protein  64.57 
 
 		 230 aa  307  8e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0145195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3520  hypothetical protein  55.16 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.344482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0630  hypothetical protein  36.32 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06890  hypothetical protein  35.59 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0079  hypothetical protein  41.28 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4302  hypothetical protein  45.21 
 
 		 229 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4386  hypothetical protein  45.21 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4454  hypothetical protein  45.21 
 
 		 229 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4273  hypothetical protein  44.68 
 
 		 229 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.833084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4342  hypothetical protein  44.68 
 
 		 229 aa  162  6e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000280654 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4062  hypothetical protein  41.67 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00109067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5365  hypothetical protein  38.07 
 
 		 224 aa  155  7e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4444  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03796  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.181991  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4074  MOSC domain containing protein  37.61 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03745  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200423  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4107  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4390  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4141  hypothetical protein  37.61 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4303  hypothetical protein  37.16 
 
 		 224 aa  150  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.445001  hitchhiker  0.00595644 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0572  MOSC domain-containing protein  35.68 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1921  MOSC domain-containing protein  34.74 
 
 		 226 aa  146  3e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.919687  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1485  hypothetical protein  34.7 
 
 		 232 aa  145  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0104541  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3061  MOSC domain-containing protein  36.46 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.068485  normal  0.778276 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2076  hypothetical protein  34.68 
 
 		 228 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4906  MOSC domain-containing protein  31.98 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1839  3-alpha:MOSC  33.02 
 
 		 241 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5027  MOSC domain-containing protein  33.66 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1959  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0955  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0870  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0278  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0356222  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1005  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 229 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001034  hypothetical protein  33.48 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.907247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1138  MOSC domain-containing protein  33.49 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1159  MOSC domain-containing protein  34.16 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4891  MOSC domain-containing protein  34.31 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0553056 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0802  MOSC domain-containing protein  34.63 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0079  MOSC family protein  33.01 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0138915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2108  MOSC domain-containing protein  37.33 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0998  MOSC domain-containing protein  33.82 
 
 		 229 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.759805  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5441  MOSC domain-containing protein  33.82 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4456  MOSC domain-containing protein  32.47 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.267556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1762  MOSC domain-containing protein  32.84 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0722092  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1700  MOSC domain-containing protein  32.84 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.0000356858  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3720  MOSC domain containing protein  32.52 
 
 		 241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.050466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1157  hypothetical protein  32.89 
 
 		 241 aa  128  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5247  MOSC domain-containing protein  33.17 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5612  MOSC domain-containing protein  33.17 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882843  normal  0.283548 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1580  MOSC domain-containing protein  32.09 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000909232  normal  0.645323 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3024  mosc domain-containing protein  33.64 
 
 		 239 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.076191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1436  MOSC domain-containing protein  31.55 
 
 		 226 aa  126  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.685858  normal  0.697669 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2272  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.762242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2232  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00032832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2189  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.108105  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2440  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.377712  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2534  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.100661  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2456  hypothetical protein  35.75 
 
 		 228 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4616  MOSC domain-containing protein  32.2 
 
 		 234 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.111886  hitchhiker  0.00165938 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0907  conserved hypothetical protein (MOSC domain protein)  32.23 
 
 		 218 aa  122  6e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.995759  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00092  mosc domain protein  31.43 
 
 		 237 aa  122  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1093  MOSC domain containing protein  30.95 
 
 		 234 aa  120  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.846076 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4809  MOSC domain containing protein  32.58 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.359001 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4291  MOSC domain-containing protein  31.92 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3743  MOSC domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00289398  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4660  MOSC domain containing protein  33.5 
 
 		 220 aa  118  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.287736 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0997  MOSC domain containing protein  30.95 
 
 		 234 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.265579  normal  0.156654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4419  MOSC domain containing protein  33.01 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.326918  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2397  hypothetical protein  32.65 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2577  MOSC domain containing protein  36.07 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2246  MOSC domain-containing protein  32.18 
 
 		 229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00173443  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0684  hypothetical protein  35.33 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0402113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2936  hypothetical protein  32.65 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0245783  hitchhiker  0.00000764985 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4513  hypothetical protein  34.78 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.405643 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0036  MOSC  30.2 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.50784 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2471  hypothetical protein  31.63 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4167  MOSC domain-containing protein  34.78 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4566  hypothetical protein  32.5 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4330  hypothetical protein  34.24 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4665  hypothetical protein  34.24 
 
 		 215 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4279  MOSC domain-containing protein  33.5 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000158056  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0030  MOSC domain containing protein  32.43 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4524  hypothetical protein  33.7 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3230  MOSC domain containing protein  34.91 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4178  MOSC domain-containing protein  34.24 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0596789  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0191  MOSC domain-containing protein  30.49 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3596  MOSC domain containing protein  31.25 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.564722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>