16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0652 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  100 
 
 
212 aa  446  1e-125  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  76.42 
 
 
208 aa  338  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  37.76 
 
 
216 aa  137  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  44.59 
 
 
353 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  55.05 
 
 
187 aa  131  7.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  33.12 
 
 
217 aa  100  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  44.55 
 
 
210 aa  98.2  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  38.24 
 
 
294 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  43.24 
 
 
225 aa  92  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  40 
 
 
221 aa  91.3  9e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  39.6 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4209  prophage antirepressor  28.03 
 
 
246 aa  52.4  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000536971  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  30 
 
 
292 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1113  putative phage anti-repressor protein  23.39 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000000120514  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  30 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  24.86 
 
 
226 aa  44.3  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>