18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0323 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  440  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  76.42 
 
 		 212 aa  338  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  47.55 
 
 		 353 aa  125  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  34.18 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  55.43 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  55.32 
 
 		 187 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3574  phage anti-repressor protein AntB  35.25 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000190834 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  37.84 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  45.54 
 
 		 221 aa  95.5  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  33.54 
 
 		 294 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  47.56 
 
 		 206 aa  89.4  4e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  25.49 
 
 		 334 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  30 
 
 		 292 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1000  BRO family protein  33.9 
 
 		 211 aa  44.7  0.0009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.173667  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1060  prophage antirepressor  27.62 
 
 		 262 aa  43.5  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000214143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1205  prophage antirepressor  27.62 
 
 		 535 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.312147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1825  prophage antirepressor  27.62 
 
 		 535 aa  43.5  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1877  prophage LambdaSa2, antirepressor protein, putative  23.14 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0256664  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>