11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2212 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2212  hypothetical protein  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.803951  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4931  prophage antirepressor-like protein  66.97 
 
 		 353 aa  158  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  37.76 
 
 		 212 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2178  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0897707 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0323  hypothetical protein  34.18 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.161575  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1058  BRO domain-containing protein  34.74 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1415  prophage antirepressor  44.44 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000182946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1061  prophage antirepressor-like protein  38.24 
 
 		 210 aa  93.6  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179859  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1080  prophage antirepressor-like protein  38.24 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174443  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1645  prophage antirepressor  38.32 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  41.18 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>