19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_2914 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  100 
 
 
226 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  78.92 
 
 
224 aa  366  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  81.58 
 
 
264 aa  197  7e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2877  antirepressor protein  83.65 
 
 
334 aa  188  7e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364001 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  81.73 
 
 
292 aa  182  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  50.92 
 
 
186 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  62.9 
 
 
187 aa  153  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  57.81 
 
 
301 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2915  putative open reading frame  54.61 
 
 
252 aa  144  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00206178  hitchhiker  0.00000000000536693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3185  hypothetical protein  55.56 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  47.01 
 
 
264 aa  108  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  44.76 
 
 
262 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  46.74 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1101  Phage anti-repressor protein  45.54 
 
 
240 aa  79.7  0.00000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3692  hypothetical protein  25.66 
 
 
165 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0652  gp30  24.86 
 
 
212 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0371314  hitchhiker  0.0000154147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0837  hypothetical protein  29.06 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0500542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2843  hypothetical protein  25.6 
 
 
240 aa  41.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  24.8 
 
 
237 aa  41.6  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>