19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1101 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1101  Phage anti-repressor protein  100 
 
 		 240 aa  495  1e-139  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  45.22 
 
 		 264 aa  96.3  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  45.22 
 
 		 264 aa  94.4  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  45.54 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  45.45 
 
 		 186 aa  85.5  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  48.42 
 
 		 187 aa  82  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  39.26 
 
 		 262 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  30.26 
 
 		 278 aa  81.3  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  40.32 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3185  hypothetical protein  38.6 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2915  putative open reading frame  39.26 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00206178  hitchhiker  0.00000000000536693 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  45.74 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  40.57 
 
 		 301 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  28.66 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2768  hypothetical protein  30.4 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.703396  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0837  hypothetical protein  25 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0500542  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1302  hypothetical protein  25.36 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2843  hypothetical protein  25.36 
 
 		 240 aa  45.4  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2072  hypothetical protein  27.64 
 
 		 240 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.266312  normal  0.075058 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>