15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2209 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  52.43 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2915  putative open reading frame  57.04 
 
 		 252 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00206178  hitchhiker  0.00000000000536693 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3185  hypothetical protein  61.29 
 
 		 209 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  63.71 
 
 		 224 aa  160  3e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  60.83 
 
 		 186 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  57.81 
 
 		 226 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  59.82 
 
 		 187 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  45.59 
 
 		 264 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  49.55 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  51.04 
 
 		 237 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0655  KilA, N- domain protein  49.35 
 
 		 284 aa  83.6  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.243495  hitchhiker  0.00000329473 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1101  Phage anti-repressor protein  40.57 
 
 		 240 aa  71.6  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1555  antirepressor protein  44.59 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0345805  hitchhiker  0.000277946 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2380  BRO domain-containing protein  25.17 
 
 		 335 aa  43.9  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.016925  normal  0.26363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>