21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0653 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  540  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  67.73 
 
 
237 aa  294  8e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  47.62 
 
 
264 aa  231  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3960  hypothetical protein  38.02 
 
 
254 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3544  hypothetical protein  58.33 
 
 
224 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  hitchhiker  0.000000000055624 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3185  hypothetical protein  50 
 
 
209 aa  115  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2209  hypothetical protein  49.55 
 
 
301 aa  107  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.780892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2915  putative open reading frame  41.22 
 
 
252 aa  102  6e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00206178  hitchhiker  0.00000000000536693 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  45.37 
 
 
264 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  44.76 
 
 
226 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  42.61 
 
 
186 aa  95.5  9e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  33.14 
 
 
187 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  41.67 
 
 
237 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1101  Phage anti-repressor protein  39.26 
 
 
240 aa  75.5  0.0000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  23.87 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3692  hypothetical protein  26.17 
 
 
165 aa  49.3  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  32.1 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  26.76 
 
 
399 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2768  hypothetical protein  22.69 
 
 
237 aa  43.9  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.703396  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  24.11 
 
 
403 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1302  hypothetical protein  24.59 
 
 
238 aa  43.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.226488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>