15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3692 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3692  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  340  5e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2768  hypothetical protein  37.39 
 
 
237 aa  75.9  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.703396  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  36.52 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2843  hypothetical protein  34.23 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1302  hypothetical protein  34.23 
 
 
238 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2072  hypothetical protein  34.23 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.266312  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3960  hypothetical protein  35.14 
 
 
254 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  31.34 
 
 
264 aa  65.1  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  25.16 
 
 
278 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  26.17 
 
 
262 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2914  putative open reading frame  25.66 
 
 
226 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0105726  hitchhiker  0.00000000000553867 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2824  hypothetical protein  29.13 
 
 
187 aa  47.4  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.108057  normal  0.198453 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0837  hypothetical protein  25.42 
 
 
209 aa  47.4  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0500542  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  27.1 
 
 
186 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2244  hypothetical protein  24.22 
 
 
264 aa  41.6  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0101557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>