13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3960 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3960  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2768  hypothetical protein  50.36 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.703396  normal  0.2318 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1237  hypothetical protein  36.76 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0653  hypothetical protein  38.02 
 
 		 262 aa  151  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0219552  hitchhiker  0.0000163196 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1054  hypothetical protein  40.58 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.250524  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0676  hypothetical protein  36.33 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.724654  hitchhiker  0.000000616618 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1302  hypothetical protein  46.62 
 
 		 238 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.226488 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2072  hypothetical protein  46.1 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.266312  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2843  hypothetical protein  45.95 
 
 		 240 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3221  hypothetical protein  50.83 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.393793  normal  0.185811 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0837  hypothetical protein  36.43 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0500542  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3692  hypothetical protein  35.14 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2967  hypothetical protein  22.73 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000420619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>