25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C3136 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3136  Cse2 family CRISPR-associated protein  100 
 
 		 186 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3253  crispr-associated protein, Cse2 family  99.46 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.872797  normal  0.58166 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3070  crispr-associated protein, Cse2 family  92.31 
 
 		 182 aa  348  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2887  CRISPR-associated Cse2 family protein  70.59 
 
 		 178 aa  245  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.680998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3061  CRISPR-associated Cse2 family protein  64.32 
 
 		 178 aa  242  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4012  CRISPR-associated protein, Cse2 family  64.52 
 
 		 178 aa  221  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0958  hypothetical protein  39.56 
 
 		 181 aa  112  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2985  CRISPR-associated Cse2 family protein  35.2 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0399  CRISPR-associated protein, Cse2 family  35.61 
 
 		 211 aa  98.2  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00469479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2478  CRISPR-associated protein, Cse2 family  36.42 
 
 		 188 aa  97.4  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3096  crispr-associated protein, Cse2 family  35.45 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00223272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00867  CRISPR-associated protein, Cse2 family  31.87 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3152  CRISPR-associated protein Cse2 family  33.86 
 
 		 200 aa  82.4  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3546  CRISPR-associated Cse2 family protein  33.33 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.407914  normal  0.0760503 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0228  hypothetical protein  32.62 
 
 		 230 aa  79.7  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1606  CRISPR-associated protein, Cse2 family  33.33 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0595  hypothetical protein  30.57 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000035066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3589  CRISPR-associated protein, Cse2 family  47 
 
 		 219 aa  72  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1379  hypothetical protein  26.03 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00330561  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0426  CRISPR-associated protein, Cse2 family  26.94 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00624745  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3316  hypothetical protein  29.11 
 
 		 179 aa  61.2  0.000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.531087  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5413  CRISPR-associated protein, Cse2 family  33.08 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0863  hypothetical protein  27.71 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1812  hypothetical protein  27.85 
 
 		 179 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0173  CRISPR-associated Cse2 family protein  32.73 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>