23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3061 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3061  CRISPR-associated Cse2 family protein  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4012  CRISPR-associated protein, Cse2 family  97.19 
 
 		 178 aa  337  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2887  CRISPR-associated Cse2 family protein  85.39 
 
 		 178 aa  292  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.680998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3070  crispr-associated protein, Cse2 family  64.67 
 
 		 182 aa  234  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3136  Cse2 family CRISPR-associated protein  64.32 
 
 		 186 aa  225  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3253  crispr-associated protein, Cse2 family  63.78 
 
 		 186 aa  223  8e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.872797  normal  0.58166 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0958  hypothetical protein  37.02 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2985  CRISPR-associated Cse2 family protein  34.08 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2478  CRISPR-associated protein, Cse2 family  32.74 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1606  CRISPR-associated protein, Cse2 family  35.47 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3096  crispr-associated protein, Cse2 family  33.33 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00223272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3546  CRISPR-associated Cse2 family protein  26.09 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.407914  normal  0.0760503 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0399  CRISPR-associated protein, Cse2 family  37.29 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00469479  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0595  hypothetical protein  28.05 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000035066  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3152  CRISPR-associated protein Cse2 family  32.05 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00867  CRISPR-associated protein, Cse2 family  30.52 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0228  hypothetical protein  29.61 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0426  CRISPR-associated protein, Cse2 family  29.44 
 
 		 196 aa  57  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00624745  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3589  CRISPR-associated protein, Cse2 family  39.39 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0863  hypothetical protein  32.22 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1379  hypothetical protein  28.95 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00330561  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5413  CRISPR-associated protein, Cse2 family  34.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3316  hypothetical protein  26.42 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.531087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>