24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1606 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1606  CRISPR-associated protein, Cse2 family  100 
 
 		 178 aa  373  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.823422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0595  hypothetical protein  50.35 
 
 		 143 aa  156  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000035066  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1379  hypothetical protein  42.07 
 
 		 174 aa  136  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00330561  normal  0.354679 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0863  hypothetical protein  31.95 
 
 		 168 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2478  CRISPR-associated protein, Cse2 family  31.91 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2985  CRISPR-associated Cse2 family protein  33.33 
 
 		 192 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3070  crispr-associated protein, Cse2 family  33.15 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3061  CRISPR-associated Cse2 family protein  35.47 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0958  hypothetical protein  35.06 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4012  CRISPR-associated protein, Cse2 family  33.73 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.113607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3136  Cse2 family CRISPR-associated protein  33.33 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.776659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3253  crispr-associated protein, Cse2 family  32.75 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.872797  normal  0.58166 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2887  CRISPR-associated Cse2 family protein  29.59 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.680998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3152  CRISPR-associated protein Cse2 family  30.54 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.817058 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0173  CRISPR-associated Cse2 family protein  31.64 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.604999  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3316  hypothetical protein  25.79 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.531087  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0426  CRISPR-associated protein, Cse2 family  31.08 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00624745  normal  0.0771696 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0399  CRISPR-associated protein, Cse2 family  34.31 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00469479  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00867  CRISPR-associated protein, Cse2 family  27.68 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5413  CRISPR-associated protein, Cse2 family  28.85 
 
 		 205 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3546  CRISPR-associated Cse2 family protein  24.83 
 
 		 206 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.407914  normal  0.0760503 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1812  hypothetical protein  25.16 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3589  CRISPR-associated protein, Cse2 family  34.38 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0228  hypothetical protein  29.71 
 
 		 230 aa  42.4  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>