56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A3615 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  85.68 
 
 		 451 aa  783    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  85.65 
 
 		 451 aa  780    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  99.78 
 
 		 457 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  85.43 
 
 		 451 aa  779    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  85.65 
 
 		 451 aa  780    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  85.43 
 
 		 451 aa  779    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  85.65 
 
 		 451 aa  780    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  100 
 
 		 457 aa  902    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  99.78 
 
 		 457 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  85.2 
 
 		 451 aa  779    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  79.3 
 
 		 452 aa  712    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  99.78 
 
 		 457 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  99.78 
 
 		 457 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  85.65 
 
 		 451 aa  780    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  85.65 
 
 		 451 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  64 
 
 		 463 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  45.32 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  45.32 
 
 		 419 aa  380  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  42.99 
 
 		 445 aa  360  3e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  41.72 
 
 		 452 aa  341  1e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  41.72 
 
 		 452 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  40.14 
 
 		 448 aa  338  9.999999999999999e-92  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  40.53 
 
 		 415 aa  333  3e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  39.29 
 
 		 453 aa  332  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.19 
 
 		 452 aa  321  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  40.19 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.19 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  40.19 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  44.56 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  44.56 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  44.56 
 
 		 437 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  39.79 
 
 		 469 aa  311  1e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  44.33 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  44.33 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  44.33 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  44.33 
 
 		 437 aa  303  6.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  44.06 
 
 		 437 aa  302  1e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  34.66 
 
 		 454 aa  297  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.52 
 
 		 421 aa  291  2e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  37.24 
 
 		 469 aa  287  2.9999999999999996e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  37.79 
 
 		 440 aa  278  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  35.15 
 
 		 456 aa  272  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  34.06 
 
 		 456 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.94 
 
 		 474 aa  260  4e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  32.61 
 
 		 453 aa  246  6e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  34.87 
 
 		 417 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  34.87 
 
 		 417 aa  226  9e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  28.3 
 
 		 440 aa  179  1e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  31.23 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.16 
 
 		 469 aa  154  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  25.42 
 
 		 483 aa  147  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  24.62 
 
 		 484 aa  140  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  25.98 
 
 		 482 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  24.56 
 
 		 472 aa  120  7e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  24.17 
 
 		 470 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  21.24 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.372507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>