56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1671 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  74.1 
 
 
484 aa  707    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  100 
 
 
470 aa  934    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  60.85 
 
 
483 aa  584  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  65.34 
 
 
438 aa  554  1e-156  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.372507 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  45.51 
 
 
469 aa  410  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  31.38 
 
 
445 aa  199  1.0000000000000001e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  29.33 
 
 
469 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  28.5 
 
 
419 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  28.5 
 
 
419 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  28.76 
 
 
452 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  28.76 
 
 
452 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  30.31 
 
 
452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  30.31 
 
 
452 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  30.31 
 
 
452 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  30.31 
 
 
452 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  28.05 
 
 
417 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  27.23 
 
 
469 aa  163  5.0000000000000005e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  27.59 
 
 
417 aa  160  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  26.17 
 
 
415 aa  157  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  28.68 
 
 
448 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  26.75 
 
 
459 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.67 
 
 
457 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  24.67 
 
 
457 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.67 
 
 
457 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.67 
 
 
457 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.67 
 
 
457 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  26.03 
 
 
451 aa  150  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.81 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  25.81 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  25.81 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.81 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.81 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.81 
 
 
451 aa  149  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  27.52 
 
 
453 aa  147  6e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.6 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.6 
 
 
451 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  26.39 
 
 
421 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.15 
 
 
463 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  28.48 
 
 
474 aa  136  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.55 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  28.57 
 
 
440 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  23.57 
 
 
454 aa  128  3e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  27.12 
 
 
453 aa  127  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  22.77 
 
 
456 aa  123  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  22.14 
 
 
456 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  25.39 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  25.39 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.39 
 
 
437 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  24.94 
 
 
437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  25.58 
 
 
437 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  25.58 
 
 
437 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  25.58 
 
 
437 aa  111  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  25.58 
 
 
437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  27.23 
 
 
482 aa  91.3  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  21.12 
 
 
440 aa  78.2  0.0000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  20.88 
 
 
472 aa  65.9  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>