56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3720 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  100 
 
 
415 aa  802    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  46.51 
 
 
419 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  46.51 
 
 
419 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  49.88 
 
 
453 aa  390  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  49.51 
 
 
454 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  43.83 
 
 
448 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  43 
 
 
445 aa  361  1e-98  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  42.51 
 
 
452 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  42.51 
 
 
452 aa  347  3e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  44.73 
 
 
469 aa  346  4e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  40.53 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  40.53 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  40.53 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  40.53 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  40.53 
 
 
457 aa  338  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.78 
 
 
451 aa  334  1e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  40.78 
 
 
451 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  40.78 
 
 
451 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.78 
 
 
451 aa  334  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  40.78 
 
 
451 aa  334  1e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.78 
 
 
451 aa  334  2e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.53 
 
 
451 aa  333  3e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  40.53 
 
 
451 aa  332  9e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.53 
 
 
451 aa  332  9e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  42.37 
 
 
463 aa  324  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  42.67 
 
 
469 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.44 
 
 
452 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.44 
 
 
452 aa  319  6e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  40.44 
 
 
452 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  40.44 
 
 
452 aa  318  7e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  39.56 
 
 
440 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  38.93 
 
 
452 aa  312  5.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  39.17 
 
 
437 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  40.34 
 
 
421 aa  306  3e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  39.17 
 
 
437 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  39.17 
 
 
437 aa  306  3e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  39.42 
 
 
437 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  39.42 
 
 
437 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  39.42 
 
 
437 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  39.42 
 
 
437 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  39.17 
 
 
437 aa  295  7e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  38.11 
 
 
474 aa  285  9e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  36.08 
 
 
456 aa  260  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  35.59 
 
 
456 aa  259  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  38.02 
 
 
453 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  36.13 
 
 
417 aa  253  6e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  35.43 
 
 
417 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  33.99 
 
 
459 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  29.74 
 
 
440 aa  191  2e-47  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  30.23 
 
 
469 aa  186  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  27.5 
 
 
483 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  26.3 
 
 
482 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  26.96 
 
 
484 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  25.7 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  23.33 
 
 
472 aa  121  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  25.68 
 
 
438 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.372507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>