56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1836 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  100 
 
 
484 aa  967    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  74.1 
 
 
470 aa  677    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  72.29 
 
 
438 aa  610  1e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.372507 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  58.39 
 
 
483 aa  570  1e-161  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  43.07 
 
 
469 aa  375  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  27.91 
 
 
445 aa  179  1e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  28.51 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  28.51 
 
 
452 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  28.71 
 
 
469 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.19 
 
 
419 aa  170  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  27.19 
 
 
419 aa  170  6e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  30.2 
 
 
452 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  30.2 
 
 
452 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  30.2 
 
 
452 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  30.65 
 
 
452 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.71 
 
 
451 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  25.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  25.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.49 
 
 
451 aa  155  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.27 
 
 
451 aa  153  7e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  25.27 
 
 
451 aa  153  7e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.62 
 
 
457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.62 
 
 
457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  24.62 
 
 
457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.62 
 
 
457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  24.62 
 
 
457 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  25.95 
 
 
417 aa  150  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  25.95 
 
 
417 aa  150  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  28.61 
 
 
448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  27.38 
 
 
469 aa  147  6e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  26.23 
 
 
415 aa  142  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  24.89 
 
 
459 aa  141  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  23.13 
 
 
452 aa  137  3.0000000000000003e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.12 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.54 
 
 
454 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  26.19 
 
 
474 aa  129  8.000000000000001e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.9 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.33 
 
 
463 aa  123  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  23.91 
 
 
456 aa  124  6e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  23.81 
 
 
456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  26.41 
 
 
440 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  24.57 
 
 
453 aa  109  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  22.85 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  22.85 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  22.85 
 
 
437 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  23.99 
 
 
437 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  23.99 
 
 
437 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  23.99 
 
 
437 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  23.99 
 
 
437 aa  91.3  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  23.99 
 
 
437 aa  90.9  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  23.61 
 
 
440 aa  85.1  0.000000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  24.24 
 
 
482 aa  84  0.000000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  23.34 
 
 
472 aa  72.4  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>