56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_4825 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  89.82 
 
 
452 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  89.6 
 
 
452 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  89.6 
 
 
452 aa  775    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  100 
 
 
452 aa  887    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  100 
 
 
452 aa  887    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  89.38 
 
 
452 aa  773    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  59.24 
 
 
448 aa  565  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  46.86 
 
 
419 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  46.86 
 
 
419 aa  396  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  43.09 
 
 
453 aa  360  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  41.96 
 
 
457 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  41.96 
 
 
457 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  41.96 
 
 
457 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  41.96 
 
 
457 aa  351  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  41.72 
 
 
457 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  42.51 
 
 
415 aa  348  8e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  42.54 
 
 
445 aa  348  1e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.55 
 
 
451 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.55 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  40.55 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  40.55 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  40.55 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.55 
 
 
451 aa  342  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.32 
 
 
451 aa  342  8e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  40.32 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  40.32 
 
 
451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  41.12 
 
 
454 aa  337  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  41.25 
 
 
469 aa  325  1e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  39.55 
 
 
452 aa  323  3e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  41.36 
 
 
463 aa  322  7e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  40.25 
 
 
469 aa  303  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.756682 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  39.9 
 
 
437 aa  298  9e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  39.9 
 
 
437 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  39.9 
 
 
437 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.92 
 
 
421 aa  292  6e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  38.93 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  38.93 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  38.93 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  38.93 
 
 
437 aa  286  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  38.69 
 
 
437 aa  285  9e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  38.81 
 
 
474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  36.62 
 
 
440 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  34.92 
 
 
417 aa  267  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  35.34 
 
 
417 aa  259  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  34.45 
 
 
453 aa  239  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  34.38 
 
 
456 aa  231  1e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  35.1 
 
 
456 aa  230  4e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  34.56 
 
 
459 aa  206  8e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  30.79 
 
 
469 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  28.85 
 
 
483 aa  175  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  28.51 
 
 
484 aa  168  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  31.49 
 
 
482 aa  168  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  26.56 
 
 
440 aa  167  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  29.77 
 
 
472 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  28.38 
 
 
470 aa  144  5e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  27.33 
 
 
438 aa  119  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.372507 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>