58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1647 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  92.81 
 
 		 417 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  100 
 
 		 417 aa  819    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  34.92 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  34.92 
 
 		 452 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  38.35 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  38.35 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  37.25 
 
 		 445 aa  268  2e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.03 
 
 		 448 aa  257  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  36.13 
 
 		 415 aa  256  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  34.44 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  34.44 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  34.44 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  34.44 
 
 		 452 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  38.62 
 
 		 453 aa  239  5e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  34.68 
 
 		 454 aa  237  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  34.87 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  34.87 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  34.87 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  34.87 
 
 		 457 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  34.87 
 
 		 457 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  33.59 
 
 		 451 aa  230  4e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  33.33 
 
 		 451 aa  229  5e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  33.59 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  33.59 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  33.59 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  33.59 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  33.59 
 
 		 451 aa  230  5e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  33.86 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  33.33 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  33.33 
 
 		 451 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  33.5 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  34.09 
 
 		 452 aa  219  7.999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  36.07 
 
 		 463 aa  209  9e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  31.65 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  32.5 
 
 		 474 aa  199  7e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  31.31 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  31.31 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  31.31 
 
 		 437 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  31.16 
 
 		 469 aa  197  3e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  32.1 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  32.1 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  32.1 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  32.1 
 
 		 437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  31.83 
 
 		 437 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  29.32 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  28.87 
 
 		 456 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  29.32 
 
 		 453 aa  176  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  25.95 
 
 		 484 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  26.04 
 
 		 469 aa  147  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  28.27 
 
 		 459 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  25.67 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.34 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  26.96 
 
 		 470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  24.94 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  24.16 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  22.82 
 
 		 438 aa  95.5  2e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.372507 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1810  putative virulence factor, MviN  26.99 
 
 		 513 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0457  integral membrane protein MviN  26.99 
 
 		 513 aa  43.1  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00421085  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>