56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1835 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  100 
 
 		 438 aa  870    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.372507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  72.29 
 
 		 484 aa  645    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  65.34 
 
 		 470 aa  585  1e-166  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  51.52 
 
 		 483 aa  460  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  41.92 
 
 		 469 aa  348  1e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  25.78 
 
 		 445 aa  144  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  26.61 
 
 		 469 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  28.29 
 
 		 469 aa  141  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  29.73 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  29.73 
 
 		 452 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  29.73 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  29.73 
 
 		 452 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.34 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.34 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  26.88 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  26.88 
 
 		 452 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  25.4 
 
 		 415 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  24.31 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  24.5 
 
 		 448 aa  114  5e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  23.87 
 
 		 451 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  23.62 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  23.62 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  23.62 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  23.62 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  23.62 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  23.62 
 
 		 451 aa  110  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  23.62 
 
 		 451 aa  110  7.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  23.42 
 
 		 417 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  23.67 
 
 		 453 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  23.37 
 
 		 451 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  24.71 
 
 		 456 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  24.38 
 
 		 474 aa  106  8e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  23.9 
 
 		 456 aa  106  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  21.77 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  21.77 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  21.77 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  21.77 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  21.77 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  23.86 
 
 		 421 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.15 
 
 		 440 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  22.82 
 
 		 417 aa  101  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  22.39 
 
 		 463 aa  100  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  22.79 
 
 		 459 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  24.35 
 
 		 453 aa  92  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  26.29 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  26.29 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  26.29 
 
 		 437 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  26.29 
 
 		 437 aa  86.7  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  26.4 
 
 		 437 aa  85.5  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  20.24 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  25.07 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  25.07 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  25.07 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  20.38 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  22.11 
 
 		 482 aa  61.6  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  22.45 
 
 		 440 aa  59.7  0.00000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>