33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1955 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1955  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0066535  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0725  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.61 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2564  hypothetical protein  38.04 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.44085  normal  0.177533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2560  invasion gene expression up-regulator, SirB  39.02 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0147676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3830  hypothetical protein  32.61 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2402  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.11 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3677  invasion gene expression up-regulator SirB  33.7 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3124  invasion gene expression up-regulator SirB  38.46 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.129569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3166  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.52 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0800  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.52 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0772  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.52 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02569  Invasion gene expression up-regulator, SirB  39.47 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.351393  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0922  invasion gene expression up-regulator, SirB  33.73 
 
 		 128 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0130475  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0999  invasion gene expression up-regulator, SirB  32.52 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1287  Invasion gene expression up-regulator SirB  32.65 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0806  invasion gene expression up-regulator, SirB  30.43 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2907  invasion gene expression up-regulator, SirB  35.63 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.493009  normal  0.817295 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2335  putative transcriptional regulator  31.09 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2405  Invasion gene expression up-regulator SirB  30.47 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1885  invasion gene expression up-regulator, SirB  34.45 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.079472  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3453  invasion gene expression up-regulator, SirB  31.52 
 
 		 131 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2379  invasion gene expression up-regulator, SirB  29.91 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0944  hypothetical protein  29.6 
 
 		 127 aa  47  0.00008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2112  Invasion gene expression up-regulator SirB  31.5 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.237229  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3611  invasion gene expression up-regulator SirB  39.58 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0384528  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3734  invasion gene expression up-regulator SirB  39.58 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3543  Invasion gene expression up-regulator SirB  39.58 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.637299  hitchhiker  0.0000269359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0700  invasion gene expression up-regulator SirB  39.58 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1992  invasion gene expression up-regulator SirB  27.5 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0896381  hitchhiker  0.00421382 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2064  sirB family protein  29.41 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000433498  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2458  hypothetical protein  29.41 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.225422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2177  invasion gene expression up-regulator SirB  29.41 
 
 		 133 aa  40.8  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0939064  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2077  invasion gene expression up-regulator, SirB  29.91 
 
 		 129 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0412299  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>