34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1729 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  150  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  36.99 
 
 
74 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  37.5 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  36.11 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  41.67 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  43.06 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  36.62 
 
 
94 aa  53.9  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  36.62 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  31.43 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  36.62 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  36.62 
 
 
94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  38.89 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  36.11 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  34.72 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  39.06 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  40.32 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2864  hypothetical protein  32.79 
 
 
78 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0403984  hitchhiker  0.00610579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  36.99 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  36.99 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  28 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  38.98 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  33.8 
 
 
74 aa  45.1  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  26.39 
 
 
78 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5567  hypothetical protein  32.31 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  36.23 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  34.48 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0079  hypothetical protein  32.81 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2854  hypothetical protein  33.85 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162663  normal  0.214257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>