23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4371 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  100 
 
 
78 aa  147  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  58.9 
 
 
88 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  48.65 
 
 
94 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  48.65 
 
 
94 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  52.63 
 
 
100 aa  80.1  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  48.65 
 
 
94 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  48.65 
 
 
93 aa  77  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  45.95 
 
 
94 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  44.59 
 
 
94 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  43.24 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  43.24 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  43.24 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  52.38 
 
 
68 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  35.21 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  34.92 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  34.92 
 
 
74 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  30.65 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  25.37 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  30.99 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  31.94 
 
 
85 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  26.39 
 
 
75 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  26.76 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>