44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0888 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  194  2.0000000000000003e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  41.89 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  42.47 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  44.12 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  43.08 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  31.43 
 
 
75 aa  53.5  0.0000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  40.58 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  40.58 
 
 
83 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  33.8 
 
 
75 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  37.97 
 
 
100 aa  51.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  44.93 
 
 
74 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  43.94 
 
 
74 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0984  hypothetical protein  32.84 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0920  hypothetical protein  32.84 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1060  hypothetical protein  32.84 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10438e-37 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0905  hypothetical protein  32.84 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  38.46 
 
 
74 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0887  group-specific protein  31.34 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  33.33 
 
 
74 aa  48.9  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0079  hypothetical protein  30.99 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  35.62 
 
 
78 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1687  hypothetical protein  40.58 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  30.88 
 
 
74 aa  47.8  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  29.58 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  27.54 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2864  hypothetical protein  25.4 
 
 
78 aa  46.6  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0403984  hitchhiker  0.00610579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  28.77 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  28.77 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  28.77 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4032  hypothetical protein  43.86 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0730826  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1285  hypothetical protein  39.68 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62186  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  27.4 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0529  hypothetical protein  29.17 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  30.3 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  35.21 
 
 
75 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5567  hypothetical protein  29.51 
 
 
73 aa  42.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  30.3 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0491  hypothetical protein  30 
 
 
87 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  31.58 
 
 
85 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  27.27 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>