35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2687 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  100 
 
 		 74 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  98.65 
 
 		 74 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  55.41 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  47.22 
 
 		 94 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  45.83 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  45.83 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  45.83 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  45.83 
 
 		 94 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  59.72 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  43.06 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  42.47 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  43.06 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  43.06 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  45.33 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  38.89 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  32.43 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  32.43 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  40.28 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0529  hypothetical protein  34.72 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  39.71 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  36.99 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  42.86 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  33.33 
 
 		 78 aa  50.1  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3953  hypothetical protein  45.45 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139269  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  34.33 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  31.94 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  40.68 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1891  hypothetical protein  34.25 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.252945  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1590  hypothetical protein  33.78 
 
 		 110 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.148818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0905  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1060  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10438e-37 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0984  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315351  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0920  hypothetical protein  29.17 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2422  hypothetical protein  29.17 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615962  normal  0.0455353 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>