19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4516 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0081  hypothetical protein  48.48 
 
 		 71 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  44.44 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  38.81 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  40.58 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1707  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0362166  normal  0.161426 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  40.68 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  40.91 
 
 		 91 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  36.99 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  39.39 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  34.85 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  32.81 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1285  hypothetical protein  43.64 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62186  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1687  hypothetical protein  43.64 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  26.87 
 
 		 76 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4032  hypothetical protein  43.64 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  32.39 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0491  hypothetical protein  36.21 
 
 		 87 aa  40.4  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>