30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2198 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  100 
 
 
86 aa  176  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  44.44 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  43.08 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  40.32 
 
 
74 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  54.7  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  35.38 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  40.32 
 
 
74 aa  52  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  38.1 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  34.29 
 
 
75 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  41.27 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  31.43 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  37.7 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  37.7 
 
 
74 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1285  hypothetical protein  41.54 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62186  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  38.98 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  40 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  36.21 
 
 
93 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1687  hypothetical protein  40 
 
 
99 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4032  hypothetical protein  38.46 
 
 
86 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0730826  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  34.43 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  32.05 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  34.48 
 
 
94 aa  41.2  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>