29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3643 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  150  7e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  34.21 
 
 		 76 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  40.58 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  36.11 
 
 		 75 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  40 
 
 		 86 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1755  hypothetical protein  37.68 
 
 		 77 aa  53.9  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  34.33 
 
 		 74 aa  50.1  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1707  hypothetical protein  39.22 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0362166  normal  0.161426 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2037  hypothetical protein  36.51 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2864  hypothetical protein  27.03 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0403984  hitchhiker  0.00610579 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  27.54 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  30.99 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0079  hypothetical protein  26.39 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  31.34 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  31.43 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  31.43 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  31.34 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  28.77 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  26.87 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  26.87 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  27.94 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  28.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  28.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  28.77 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  31.82 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5567  hypothetical protein  26.76 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  31.34 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0081  hypothetical protein  28.79 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  28.36 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>