28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2905 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  147  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  57.14 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  57.14 
 
 
74 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  50.77 
 
 
94 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  49.23 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  49.23 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  49.23 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  49.23 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  55.56 
 
 
75 aa  67.4  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  46.48 
 
 
88 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  44.62 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  44.62 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  44.62 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  44.62 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  34.21 
 
 
76 aa  57  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  39.19 
 
 
74 aa  57  0.0000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  34.72 
 
 
100 aa  53.9  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  36.11 
 
 
75 aa  53.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  35.21 
 
 
78 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  39.39 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  39.39 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  40 
 
 
68 aa  47  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  34.67 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2422  hypothetical protein  32.81 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615962  normal  0.0455353 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  31.82 
 
 
76 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2037  hypothetical protein  35.82 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>