31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2685 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  140  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  55.56 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  58.73 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  58.73 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  41.89 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  43.28 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  43.28 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  43.28 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  43.28 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  39.19 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  37.84 
 
 
75 aa  64.3  0.0000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  39.19 
 
 
93 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  41.79 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  41.79 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  40.54 
 
 
88 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  35.14 
 
 
100 aa  52.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  39.68 
 
 
68 aa  50.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  37.33 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  29.33 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  40.3 
 
 
78 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  31.94 
 
 
74 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  43.06 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  43.06 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  30.99 
 
 
76 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0529  hypothetical protein  31.43 
 
 
76 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3953  hypothetical protein  35.14 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139269  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  33.78 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2422  hypothetical protein  29.73 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615962  normal  0.0455353 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2037  hypothetical protein  38.33 
 
 
77 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  25.68 
 
 
74 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>