23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1511 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  184  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  88.3 
 
 
94 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  87.23 
 
 
94 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  93.9 
 
 
94 aa  154  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  85.88 
 
 
94 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  80.95 
 
 
94 aa  140  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  79.76 
 
 
94 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  79.76 
 
 
94 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  79.76 
 
 
94 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  50.67 
 
 
88 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  48.65 
 
 
78 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  54.29 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  44.62 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  37.5 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  39.19 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  31.88 
 
 
74 aa  52  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  39.68 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  40.32 
 
 
74 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  35.82 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  36.21 
 
 
86 aa  42.4  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  30.56 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  27.27 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>