28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3029 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 94 aa  186  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  88.3 
 
 		 93 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  87.23 
 
 		 94 aa  161  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  86.17 
 
 		 94 aa  160  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  81.91 
 
 		 94 aa  159  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  77.42 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  77.42 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  77.42 
 
 		 94 aa  148  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  78.49 
 
 		 94 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  48.86 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  48.65 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  55.71 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2323  hypothetical protein  52.31 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  44.62 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  44.44 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  45.16 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  31.94 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  39.19 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  38.81 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2422  hypothetical protein  29.33 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615962  normal  0.0455353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  31.34 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  30.3 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0529  hypothetical protein  27.4 
 
 		 76 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.911072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3953  hypothetical protein  34.72 
 
 		 78 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139269  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0411  hypothetical protein  29.17 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  33.33 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  34.48 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>