14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0601 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  177  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5067  hypothetical protein  63.89 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.95796  normal  0.193146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1285  hypothetical protein  64.18 
 
 		 86 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.62186  normal  0.663056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0491  hypothetical protein  52.05 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1687  hypothetical protein  61.54 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.837168 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4032  hypothetical protein  61.54 
 
 		 86 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0730826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  41.89 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  40.91 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  38.1 
 
 		 86 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  32.79 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2978  hypothetical protein  48.72 
 
 		 40 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  32.31 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>