17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2854 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2854  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  151  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162663  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5567  hypothetical protein  54.41 
 
 
73 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2864  hypothetical protein  55.22 
 
 
78 aa  87.8  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0403984  hitchhiker  0.00610579 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0079  hypothetical protein  53.73 
 
 
73 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  32.84 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  33.85 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  34.33 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  31.75 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1755  hypothetical protein  33.33 
 
 
77 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137723  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  25 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0905  hypothetical protein  37.88 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0984  hypothetical protein  37.88 
 
 
79 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.315351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1060  hypothetical protein  37.88 
 
 
79 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10438e-37 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0920  hypothetical protein  37.88 
 
 
79 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0887  group-specific protein  37.88 
 
 
79 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  32.26 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1891  hypothetical protein  33.85 
 
 
79 aa  40.8  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.252945  normal  0.803766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>