260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0439 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0439  transketolase  100 
 
 		 146 aa  300  3.0000000000000004e-81  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  32.09 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  29.08 
 
 		 145 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  32.81 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  29.32 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  30.65 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  30.65 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  30.65 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  30.65 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  30.65 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  30.65 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  30.65 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  30.71 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  33.06 
 
 		 170 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  30.15 
 
 		 148 aa  67.4  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  27.82 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  32.03 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 		 140 aa  63.5  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.3 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2004  acetyltransferase  30.71 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000354216  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0042  acetyltransferase  27.89 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0968  GCN5-related N-acetyltransferase  31.68 
 
 		 109 aa  61.6  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 287 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  28.79 
 
 		 287 aa  60.1  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  30.53 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  29.2 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0404  acetyltransferase  26.76 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  29.06 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  26.83 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001898  galactoside O-acetyltransferase  32.52 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 		 289 aa  57.8  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2312  hypothetical protein  32.52 
 
 		 310 aa  57.4  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00595  acetyltransferase  32.52 
 
 		 300 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1016  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1114  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  26.19 
 
 		 146 aa  57  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  28.69 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  28.91 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  27.66 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  26.98 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  29.23 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1654  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.670285  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  26.61 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  23.62 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3913  GCN5-related N-acetyltransferase  27.01 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0902  acetyltransferase  28.57 
 
 		 298 aa  54.7  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0798  GCN5-related N-acetyltransferase  28.15 
 
 		 143 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  26.77 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0509  GCN5-related N-acetyltransferase  24.79 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2936  putative acyltransferase  30.08 
 
 		 299 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0988  acetyltransferase  24.24 
 
 		 144 aa  53.5  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0199888  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_860  acetyltransferase, GNAT family  23.24 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0788969  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  26.77 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0429  GCN5-related N-acetyltransferase  24.6 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  27.42 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 287 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05633  hypothetical protein  24.44 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10100  predicted acyltransferase  27.78 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.374622  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3035  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1347  acetyltransferase  38.24 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.25 
 
 		 149 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2770  GCN5-related N-acetyltransferase  30.56 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  25.19 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  22.83 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  25.19 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  25.38 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1719  GCN5-related N-acetyltransferase  31.51 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  25.81 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0647  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 		 151 aa  50.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0916694 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2022  GCN5-related N-acetyltransferase  25.19 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0535871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0037  acetyltransferase domain-containing protein  23.81 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2522  acetyltransferase  25.19 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369491  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  27.87 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0032  acetyltransferase domain-containing protein  23.81 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  23.81 
 
 		 143 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4184  thioesterase domain-containing protein  23.81 
 
 		 307 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  26.23 
 
 		 521 aa  49.7  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6154  GCN5-related N-acetyltransferase  27.4 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229452  normal  0.103158 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09653  Acetyltransferase  28.81 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.589876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02345  elaA protein  29.46 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1847  acetyltransferase  29.79 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 286 aa  49.3  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0520  acetyltransferase  29.79 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0423  acetyltransferase  29.79 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>