18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_0522 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_0522  putative small-conductance mechanosensitive channel  100 
 
 		 331 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  99.09 
 
 		 549 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  98.19 
 
 		 549 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  98.79 
 
 		 549 aa  650    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  64.07 
 
 		 551 aa  408  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  64.37 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  64.07 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0560.2  small-conductance mechanosensitive channel  68.04 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  49.24 
 
 		 547 aa  297  2e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  49.14 
 
 		 544 aa  273  3e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  47.43 
 
 		 540 aa  252  6e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  43.5 
 
 		 533 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  41.09 
 
 		 538 aa  243  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  44.44 
 
 		 547 aa  238  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  30.21 
 
 		 563 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  27.76 
 
 		 532 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  25.68 
 
 		 534 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  22.74 
 
 		 561 aa  76.6  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>