53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3484 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1164  transposase, IS4 family protein  98.26 
 
 		 1323 bp  2440    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.417072  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1671  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1323 bp  2623    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000299325  hitchhiker  0.00155503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2295  transposase IS4 family protein  98.11 
 
 		 1323 bp  2424    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00969572  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2940  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1323 bp  2623    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.517731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3031  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1323 bp  2623    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3185  transposase IS4 family protein  98.87 
 
 		 1323 bp  2504    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.100541 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3484    100 
 
 		 1993 bp  3951    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3485  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 1323 bp  2623    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3676  NTPase  99.5 
 
 		 561 bp  775    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2417  transposase IS4 family protein  97.81 
 
 		 1323 bp  2393    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.424861  hitchhiker  0.000136578 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3915  transposase IS4 family protein  97.83 
 
 		 1341 bp  2422    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3554  NTPase  97.99 
 
 		 561 bp  726    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4179  transposase, IS4 family protein  98.34 
 
 		 1323 bp  2448    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0206865  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3808  transposase, IS4 family protein  97.88 
 
 		 1323 bp  2401    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1414  transposase, IS4 family protein  98.34 
 
 		 1323 bp  2448    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0763  NTPase  97.74 
 
 		 561 bp  720    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0724  transposase, IS4 family protein  97.51 
 
 		 1137 bp  2006    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0665  transposase, IS4 family protein  97.61 
 
 		 1341 bp  2399    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4077  transposase IS4 family protein  99.92 
 
 		 1323 bp  2615    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.775632  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1093  ISSod7, transposase  92.06 
 
 		 1323 bp  1790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1833  ISSod7, transposase  92.06 
 
 		 1323 bp  1790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3544  ISSod7, transposase  92.06 
 
 		 1323 bp  1790    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0694    95.07 
 
 		 1341 bp  2129    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00319575  unclonable  0.0000319314 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4135  ISSod7, transposase  91.91 
 
 		 1323 bp  1774    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0859  NTPase  86.21 
 
 		 555 bp  258  5.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0727    96.21 
 
 		 162 bp  222  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0917  NTPase  84.75 
 
 		 540 bp  172  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3367  NTPase  86.55 
 
 		 540 bp  157  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3264  NTPase  81.67 
 
 		 540 bp  143  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0759  NTPase  80.6 
 
 		 540 bp  133  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.602659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0770  NTPase  82.01 
 
 		 540 bp  77.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2790  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3707  IS4 ORF  90.24 
 
 		 1188 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000458395  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2977  IS4 ORF  90.24 
 
 		 1203 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0325653  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1741  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000150228  unclonable  2.9887999999999996e-21 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3754  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4113  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04103  hypothetical protein  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2762  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0503533  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2546  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2496  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2324  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000109672  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2280  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2056  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2027  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1347 bp  50.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000537624  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0862  NTPase  87.76 
 
 		 564 bp  50.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4353  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.621464 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2916  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00217078  normal  0.61002 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2573  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.163039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2212  IS4 transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0327329  normal  0.418952 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04140  IS4 predicted transposase  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3723  transposase IS4 family protein  90.24 
 
 		 1329 bp  50.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2774  NTPase  85.71 
 
 		 564 bp  48.1  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0124832  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>